ไมเคิ่ล สกอฟิลล์ และพรรคพวกได้รับข้อเสนอจากหน่วยงานลับที่ต้องการจะล้มล้าง The Company จึงบังคับให้ ไมเคิล และเพื่อนมาทำหน้าที่นี้ เพื่อแลกกับอิสระภาพและความลับของซาร่า ที่ทุกคนคิดว่าเธอได้ตายไปแล้วใน ซีซั่น 3 แต่แท้จริงแล้วเธอยังมีชีวิตอยู่ เพราะแม้แต่ลินคอนเองก็ยังไม่แน่ใจว่า หัวของผู้หญิงที่ตนเห็นนั้น เป็นของซาร่าจริงหรือไม่